MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_C

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010940	AT	3	6	35	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010940	TTA	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010940	AAAATA	2	12	104	115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010940	A	7	7	115	121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010940	TAT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010940	TGT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010940	ACT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010940	A	7	7	288	294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010940	CAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010940	CAAT	2	8	399	406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010940	TAC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010940	TTC	2	6	528	533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010940	TTG	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010940	ACT	2	6	644	649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010940	AAC	2	6	652	657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010940	TTA	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010940	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010940	A	6	6	912	917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010940	AAAAC	2	10	959	968	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010940	TAC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010940	GTA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010940	TTAC	2	8	1177	1184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010940	AAT	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010940	T	6	6	1346	1351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010940	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010940	TCA	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010940	ATTTAT	2	12	1488	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010940	TC	3	6	1508	1513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010940	TTC	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010940	TCT	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010940	TAA	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010940	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010940	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010940	TTC	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.